Засорение канализационных труб является наиболее катастрофической причиной неисправности канализационной системы. Обычно, при засорении канализационных труб засоряется только отдельный участок, однако все остальные участки трубы остаются вполне пригодными к эксплуатации. Чаще всего, засоряются горизонтальные участки в местах провисания трубопровода, когда образуются обратные углы наклона трубы. Так же часто засоряются стояки, когда в них попадают такие посторонние предметы, как тряпки или толстая бумага. В таких случаях, производится прочистка трубопроводов с использованием ершика на стальной проволоке. Однако если успеть заметить первые признаки замедления скорости отвода канализационных вод, исправить положение можно с помощью химических реактивов, известных под названием «Крот».

Со временем в трубопроводах могут образовываться отверстия, которые принято называть свищами. Ремонтируются такие свищи на раструбах с помощью подмотки пакли или полиэтиленовой подмоткой. Трещины в полиэтиленовых трубах удаляются с помощью пайки трубы или с помощью нанесения эпоксидного клея с прокладкой из стеклоткани. Ремонт стальных и чугунных труб производится путем установки наружной резиновой заплатки, которая притягивается к трубе, с помощью хомута.